Demonstrationerna sker en dag efter ett misslyckat försök att gripa den avstängde presidenten Yoon Suk-Yeol.
Yoon har hållit sig gömd i presidentens residens, omgiven av hundratals lojala säkerhetsvakter som hittills har kunnat förhindra åklagarnas försök att gripa honom.
Demonstranten Kim Chul-hong, 60, säger att ett gripande av Yoon skulle kunna undergräva Sydkoreas säkerhetsallians med USA och Japan.
— Att skydda president Yoon innebär att skydda vårt lands säkerhet mot hot från Nordkorea, säger han till AFP.
Medlemmar i Koreanska fackföreningsrörelsen, Sydkoreas största fackliga paraplyorganisation, försökte marschera till Yoons bostad i protest, men stoppades av polis.
Fackförbundet uppger att två av dess medlemmar har gripits och att flera andra skadats i sammandrabbningar.
Yoon utreds med anledning av att han i början av december utlyste undantagstillstånd, vilket kastade in Sydkorea i politiskt kaos. Han fråntogs sin presidentmakt den 14 december, sedan parlamentet röstat för att ställa honom inför riksrätt.
