Flera fångar lyckades fly under oroligheterna. Tretton av dem uppges ha gripits på nytt.
Det tidigare relativt säkra Ecuador har de senaste åren drabbats av en kraftig våldsvåg med kopplingar till organiserad brottslighet. Landet, som ligger mellan Colombia och Peru där en stor del av världens kokain produceras, har utnyttjats av drogkartellerna som nytt transitland för exporten till Europa och Nordamerika.
Hundratals fångar har de senaste åren dödats i de brutala gängkrig som följt i utvecklingens spår.