Arrangörerna bakom Global Sumud Flotilla (GSF) säger på sociala medier natten till onsdag att man hört explosioner på flera av båtarna samtidigt som man sett flera drönare i luften. Enligt GSF ska deras kommunikationskanaler och hjälpmeddelanden vara blockerade.
"Vi bevittnar dessa psykologiska operationer på nära håll just nu, men vi kommer inte att låta oss skrämmas", skriver man i ett uttalande.
Ingen har rapporterats skadad.
Konvojen befinner sig just nu utanför Greklands kust. Enligt GSF är organisationens avsikt med resan att ”bryta den illegala belägringen” av Gazaremsan genom att öppna en humanitär korridor sjövägen. Förutom Greta Thunberg befinner sig även riksdagsledamoten Lorena Delgado Varas som nyligen hoppade av Vänsterpartiet, och den fransk-palestinska EU-parlamentarikern Rima Hassan på konvojen.
Israel anklagar konvojen för att vara terrorkopplad.
”Det här är inte humanitärt. Det är ett jihad-initiativ som tjänar terrorgruppens (Hamas) agenda”, har det israeliska utrikesdepartementet tidigare skrivit i ett inlägg på X.
Anklagelserna kommer sedan några av företrädarna för GSF:s styrgrupp synts på bilder tillsammans med företrädare för Hamas, Islamiska jihad och Folkfronten för Palestinas befrielse (PFLP) som alla är terrorklassade av USA och EU.
Tidigare i september uppgav Global Sumud Flotilla att deras fartyg två nätter i rad utsattes för angrepp av vad man misstänker var drönare.