25-åringen blev fyra i det andra försöksheatet på tiden 10,22 sekunder. Larsson var en hundradel från att hamna bland de tre främsta som tog sig till semifinal.
— Jag känner inte igen mig själv. Jag är en bättre löpare än jag var för två år sedan och då sprang jag 10,16 och tog mig till semifinal, säger han.
Tiden i Japan var elva hundradelar från hans årsbästa på 10,11 och ytterligare tre hundradelar från hans svenska rekord på 10,08 från i fjol.
I våras tog Larsson silver på 60 meter på inomhus-EM i Apeldoorn, Nederländerna.
Svensken får en ny chans på Nationalarenan, då han är med på 200 meter som inleds på onsdag.
